Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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