Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms