Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3USZ8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3USZ8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3USZ8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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