Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW5

Rnf10, RING finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf10Q3UIW5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf10Q3UIW5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms