Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Mier3Q3UHF3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mier3Q3UHF3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mier3Q3UHF3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mier3Q3UHF3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mier3Q3UHF3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Mier3Q3UHF3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mier3Q3UHF3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
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