Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms