Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Rpusd3Q14AI6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Rpusd3Q14AI6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Rpusd3Q14AI6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Rpusd3Q14AI6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Rpusd3Q14AI6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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