Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms