Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms