Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms