Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas2P97460 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas2P97460 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas2P97460 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas2P97460 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Npas2P97460 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas2P97460 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas2P97460 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms