Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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