Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx1P81068 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Irx1P81068 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx1P81068 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Irx1P81068 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Irx1P81068 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Irx1P81068 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Irx1P81068 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Irx1P81068 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx1P81068 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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Irx1P81068 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx1P81068 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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