Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx2P80206 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx2P80206 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx2P80206 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx2P80206 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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