Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54lP70270 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms