Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms