Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme3P61290 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme3P61290 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme3P61290 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme3P61290 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme3P61290 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms