Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt6aP50446 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms