Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epb41P48193 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epb41P48193 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epb41P48193 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epb41P48193 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epb41P48193 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb41P48193 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb41P48193 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb41P48193 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb41P48193 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb41P48193 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb41P48193 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Epb41P48193 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb41P48193 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb41P48193 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb41P48193 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb41P48193 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb41P48193 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Epb41P48193 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb41P48193 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb41P48193 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb41P48193 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb41P48193 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb41P48193 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Epb41P48193 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb41P48193 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb41P48193 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb41P48193 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Epb41P48193 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb41P48193 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Epb41P48193 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Epb41P48193 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb41P48193 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Epb41P48193 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Epb41P48193 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb41P48193 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Epb41P48193 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Epb41P48193 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Epb41P48193 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epb41P48193 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epb41P48193 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epb41P48193 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Epb41P48193 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epb41P48193 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Epb41P48193 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epb41P48193 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epb41P48193 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epb41P48193 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epb41P48193 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Epb41P48193 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Epb41P48193 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epb41P48193 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epb41P48193 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Epb41P48193 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epb41P48193 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epb41P48193 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epb41P48193 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epb41P48193 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Epb41P48193 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Epb41P48193 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epb41P48193 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epb41P48193 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epb41P48193 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epb41P48193 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epb41P48193 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epb41P48193 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epb41P48193 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epb41P48193 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epb41P48193 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Epb41P48193 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epb41P48193 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epb41P48193 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Epb41P48193 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epb41P48193 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epb41P48193 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epb41P48193 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epb41P48193 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Epb41P48193 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Epb41P48193 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Epb41P48193 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Epb41P48193 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epb41P48193 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms