Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
InaP46660 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InaP46660 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
InaP46660 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InaP46660 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
InaP46660 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InaP46660 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InaP46660 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InaP46660 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InaP46660 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InaP46660 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InaP46660 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InaP46660 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InaP46660 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InaP46660 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
InaP46660 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
InaP46660 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
InaP46660 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InaP46660 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InaP46660 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InaP46660 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InaP46660 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InaP46660 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InaP46660 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
InaP46660 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InaP46660 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InaP46660 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InaP46660 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InaP46660 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InaP46660 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InaP46660 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
InaP46660 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
InaP46660 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
InaP46660 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
InaP46660 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
InaP46660 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
InaP46660 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
InaP46660 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
InaP46660 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
InaP46660 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
InaP46660 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
InaP46660 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
InaP46660 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
InaP46660 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
InaP46660 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
InaP46660 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
InaP46660 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
InaP46660 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
InaP46660 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
InaP46660 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InaP46660 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
InaP46660 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InaP46660 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InaP46660 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
InaP46660 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InaP46660 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
InaP46660 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InaP46660 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InaP46660 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
InaP46660 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InaP46660 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InaP46660 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
InaP46660 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InaP46660 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
InaP46660 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
InaP46660 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InaP46660 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InaP46660 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
InaP46660 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InaP46660 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms