Protein–RNA interactions for Protein: P35441

Thbs1, Thrombospondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1P35441 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Thbs1P35441 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Thbs1P35441 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Thbs1P35441 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Thbs1P35441 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Thbs1P35441 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Thbs1P35441 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Thbs1P35441 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Thbs1P35441 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Thbs1P35441 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Thbs1P35441 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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