Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms