Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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