Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atxn10P28658 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms