Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VimP20152 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VimP20152 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VimP20152 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VimP20152 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VimP20152 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VimP20152 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VimP20152 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VimP20152 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VimP20152 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VimP20152 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VimP20152 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VimP20152 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VimP20152 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VimP20152 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VimP20152 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VimP20152 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VimP20152 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VimP20152 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VimP20152 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VimP20152 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VimP20152 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VimP20152 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VimP20152 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VimP20152 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VimP20152 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VimP20152 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VimP20152 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VimP20152 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VimP20152 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VimP20152 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VimP20152 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VimP20152 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VimP20152 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VimP20152 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VimP20152 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VimP20152 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VimP20152 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VimP20152 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VimP20152 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VimP20152 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VimP20152 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VimP20152 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VimP20152 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VimP20152 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VimP20152 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VimP20152 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VimP20152 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VimP20152 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VimP20152 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VimP20152 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VimP20152 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VimP20152 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VimP20152 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VimP20152 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VimP20152 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VimP20152 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VimP20152 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VimP20152 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VimP20152 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VimP20152 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VimP20152 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VimP20152 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VimP20152 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VimP20152 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VimP20152 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VimP20152 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VimP20152 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VimP20152 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VimP20152 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VimP20152 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VimP20152 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VimP20152 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VimP20152 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VimP20152 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VimP20152 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VimP20152 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VimP20152 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VimP20152 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
VimP20152 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VimP20152 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VimP20152 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VimP20152 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VimP20152 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VimP20152 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VimP20152 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VimP20152 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VimP20152 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VimP20152 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VimP20152 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VimP20152 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VimP20152 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VimP20152 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VimP20152 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VimP20152 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VimP20152 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VimP20152 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VimP20152 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VimP20152 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VimP20152 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms