Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a1P19437 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms