Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04213 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04213 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04213 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04213 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04213 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04213 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04213 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P04213 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04213 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04213 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04213 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04213 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04213 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04213 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04213 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04213 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04213 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04213 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04213 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04213 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04213 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04213 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04213 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04213 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04213 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04213 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04213 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04213 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04213 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04213 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04213 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04213 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04213 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04213 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04213 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04213 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P04213 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04213 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04213 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04213 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04213 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04213 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04213 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04213 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P04213 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P04213 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P04213 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04213 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04213 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04213 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04213 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04213 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04213 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04213 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04213 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P04213 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04213 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04213 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04213 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04213 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04213 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04213 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P04213 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04213 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms