Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ccl20O89093 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Ccl20O89093 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Ccl20O89093 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Ccl20O89093 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Ccl20O89093 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Ccl20O89093 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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