Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms