Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb2O55203 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms