Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LatO54957 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LatO54957 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LatO54957 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LatO54957 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LatO54957 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LatO54957 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LatO54957 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LatO54957 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LatO54957 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LatO54957 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LatO54957 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LatO54957 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LatO54957 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LatO54957 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LatO54957 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LatO54957 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LatO54957 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LatO54957 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LatO54957 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LatO54957 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LatO54957 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LatO54957 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LatO54957 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LatO54957 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LatO54957 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LatO54957 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LatO54957 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LatO54957 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LatO54957 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LatO54957 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LatO54957 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LatO54957 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LatO54957 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LatO54957 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LatO54957 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LatO54957 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LatO54957 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LatO54957 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LatO54957 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LatO54957 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LatO54957 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LatO54957 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LatO54957 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LatO54957 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LatO54957 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms