Protein–RNA interactions for Protein: O35604

Npc1, Niemann-Pick C1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1O35604 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npc1O35604 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Npc1O35604 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Npc1O35604 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npc1O35604 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npc1O35604 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npc1O35604 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms