Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Opn1mwO35599 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Opn1mwO35599 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Opn1mwO35599 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Opn1mwO35599 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Opn1mwO35599 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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