Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms