Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms