Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2035J3QP87 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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