Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms