Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms