Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms