Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms