Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms