Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms