Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsperg2C6KI89 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsperg2C6KI89 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsperg2C6KI89 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsperg2C6KI89 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsperg2C6KI89 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsperg2C6KI89 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsperg2C6KI89 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsperg2C6KI89 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsperg2C6KI89 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsperg2C6KI89 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsperg2C6KI89 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsperg2C6KI89 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsperg2C6KI89 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms