Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms