Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms