Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms