Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0U1RNP2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms