Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms