Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms