Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV76

Ap4b1, AP-4 complex subunit beta-1, mousemouse

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Length 738 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4b1Q9WV76 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ap4b1Q9WV76 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ap4b1Q9WV76 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ap4b1Q9WV76 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ap4b1Q9WV76 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ap4b1Q9WV76 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ap4b1Q9WV76 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ap4b1Q9WV76 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ap4b1Q9WV76 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms